Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox8bP48772 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox8bP48772 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cox8bP48772 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox8bP48772 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms