Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Igfbp3P47878 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Igfbp3P47878 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Igfbp3P47878 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Igfbp3P47878 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms