Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sipa1P46062 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sipa1P46062 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sipa1P46062 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sipa1P46062 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms