Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnfsf9P41274 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfsf9P41274 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf9P41274 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms