Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl28P41105 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl28P41105 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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