Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig1P37913 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lig1P37913 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lig1P37913 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lig1P37913 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lig1P37913 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lig1P37913 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig1P37913 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lig1P37913 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lig1P37913 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lig1P37913 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lig1P37913 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lig1P37913 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lig1P37913 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms