Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfc1P35601 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rfc1P35601 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfc1P35601 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms