Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2aP34056 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2aP34056 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfap2aP34056 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfap2aP34056 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms