Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RxrgP28705 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RxrgP28705 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrgP28705 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrgP28705 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxrgP28705 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RxrgP28705 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RxrgP28705 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrgP28705 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrgP28705 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrgP28705 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrgP28705 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrgP28705 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms