Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxraP28700 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxraP28700 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxraP28700 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RxraP28700 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxraP28700 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RxraP28700 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RxraP28700 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RxraP28700 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxraP28700 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxraP28700 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxraP28700 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxraP28700 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxraP28700 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxraP28700 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxraP28700 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RxraP28700 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxraP28700 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxraP28700 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxraP28700 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RxraP28700 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RxraP28700 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxraP28700 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxraP28700 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxraP28700 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxraP28700 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxraP28700 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxraP28700 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RxraP28700 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RxraP28700 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RxraP28700 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RxraP28700 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RxraP28700 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RxraP28700 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RxraP28700 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RxraP28700 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxraP28700 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxraP28700 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxraP28700 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxraP28700 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxraP28700 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxraP28700 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxraP28700 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxraP28700 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxraP28700 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxraP28700 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxraP28700 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxraP28700 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxraP28700 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxraP28700 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxraP28700 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RxraP28700 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RxraP28700 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RxraP28700 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RxraP28700 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RxraP28700 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxraP28700 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxraP28700 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxraP28700 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxraP28700 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxraP28700 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RxraP28700 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxraP28700 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxraP28700 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxraP28700 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxraP28700 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxraP28700 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxraP28700 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxraP28700 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxraP28700 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxraP28700 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxraP28700 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxraP28700 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxraP28700 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxraP28700 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxraP28700 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxraP28700 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxraP28700 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxraP28700 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxraP28700 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RxraP28700 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RxraP28700 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RxraP28700 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxraP28700 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxraP28700 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxraP28700 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxraP28700 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxraP28700 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RxraP28700 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RxraP28700 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxraP28700 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxraP28700 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxraP28700 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxraP28700 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxraP28700 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxraP28700 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxraP28700 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxraP28700 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RxraP28700 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxraP28700 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms