Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv4P28322 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Etv4P28322 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv4P28322 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Etv4P28322 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Etv4P28322 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Etv4P28322 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv4P28322 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Etv4P28322 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv4P28322 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms