Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CftrP26361 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CftrP26361 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
CftrP26361 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CftrP26361 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CftrP26361 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CftrP26361 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CftrP26361 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CftrP26361 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CftrP26361 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CftrP26361 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CftrP26361 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CftrP26361 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CftrP26361 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CftrP26361 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CftrP26361 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CftrP26361 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CftrP26361 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CftrP26361 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CftrP26361 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CftrP26361 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CftrP26361 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CftrP26361 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CftrP26361 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CftrP26361 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CftrP26361 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CftrP26361 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CftrP26361 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CftrP26361 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CftrP26361 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
CftrP26361 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
CftrP26361 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CftrP26361 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CftrP26361 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CftrP26361 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CftrP26361 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CftrP26361 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CftrP26361 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CftrP26361 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CftrP26361 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CftrP26361 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CftrP26361 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CftrP26361 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
CftrP26361 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CftrP26361 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CftrP26361 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CftrP26361 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CftrP26361 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
CftrP26361 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CftrP26361 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CftrP26361 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
CftrP26361 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CftrP26361 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CftrP26361 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CftrP26361 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CftrP26361 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CftrP26361 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CftrP26361 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CftrP26361 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CftrP26361 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CftrP26361 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CftrP26361 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CftrP26361 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CftrP26361 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CftrP26361 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CftrP26361 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CftrP26361 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CftrP26361 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CftrP26361 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CftrP26361 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CftrP26361 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CftrP26361 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CftrP26361 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CftrP26361 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CftrP26361 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CftrP26361 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CftrP26361 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CftrP26361 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CftrP26361 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CftrP26361 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CftrP26361 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CftrP26361 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CftrP26361 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CftrP26361 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CftrP26361 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CftrP26361 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CftrP26361 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CftrP26361 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CftrP26361 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CftrP26361 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CftrP26361 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CftrP26361 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CftrP26361 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CftrP26361 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CftrP26361 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CftrP26361 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CftrP26361 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CftrP26361 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CftrP26361 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CftrP26361 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms