Protein–RNA interactions for Protein: P25446

Fas, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FasP25446 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FasP25446 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FasP25446 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FasP25446 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FasP25446 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FasP25446 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FasP25446 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FasP25446 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FasP25446 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FasP25446 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FasP25446 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FasP25446 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FasP25446 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FasP25446 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FasP25446 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FasP25446 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FasP25446 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FasP25446 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FasP25446 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FasP25446 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FasP25446 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FasP25446 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FasP25446 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FasP25446 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FasP25446 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FasP25446 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FasP25446 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FasP25446 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FasP25446 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FasP25446 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FasP25446 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FasP25446 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FasP25446 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FasP25446 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FasP25446 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FasP25446 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FasP25446 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FasP25446 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FasP25446 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FasP25446 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FasP25446 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FasP25446 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FasP25446 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FasP25446 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FasP25446 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FasP25446 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FasP25446 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FasP25446 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FasP25446 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FasP25446 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FasP25446 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FasP25446 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FasP25446 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FasP25446 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FasP25446 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FasP25446 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FasP25446 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FasP25446 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FasP25446 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FasP25446 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FasP25446 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FasP25446 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FasP25446 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FasP25446 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FasP25446 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FasP25446 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FasP25446 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FasP25446 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FasP25446 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FasP25446 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FasP25446 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FasP25446 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FasP25446 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FasP25446 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FasP25446 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FasP25446 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FasP25446 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FasP25446 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FasP25446 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FasP25446 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FasP25446 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FasP25446 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FasP25446 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FasP25446 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FasP25446 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FasP25446 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FasP25446 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FasP25446 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FasP25446 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FasP25446 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FasP25446 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms