Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mdm2P23804 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Mdm2P23804 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mdm2P23804 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Mdm2P23804 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Mdm2P23804 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Mdm2P23804 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Mdm2P23804 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdm2P23804 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Mdm2P23804 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mdm2P23804 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdm2P23804 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdm2P23804 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mdm2P23804 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mdm2P23804 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mdm2P23804 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Mdm2P23804 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mdm2P23804 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Mdm2P23804 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mdm2P23804 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mdm2P23804 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mdm2P23804 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms