Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NfyaP23708 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfyaP23708 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfyaP23708 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfyaP23708 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfyaP23708 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NfyaP23708 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfyaP23708 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms