Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcaP20444 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcaP20444 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcaP20444 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms