Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lsp1P19973 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lsp1P19973 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lsp1P19973 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lsp1P19973 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms