Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ca3P16015 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ca3P16015 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca3P16015 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca3P16015 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca3P16015 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca3P16015 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ca3P16015 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ca3P16015 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ca3P16015 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ca3P16015 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ca3P16015 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ca3P16015 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ca3P16015 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ca3P16015 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ca3P16015 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ca3P16015 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ca3P16015 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ca3P16015 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ca3P16015 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ca3P16015 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ca3P16015 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ca3P16015 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca3P16015 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ca3P16015 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ca3P16015 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ca3P16015 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ca3P16015 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.1 ms