Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp53P15975 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp53P15975 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp53P15975 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp53P15975 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp53P15975 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp53P15975 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp53P15975 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp53P15975 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp53P15975 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp53P15975 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp53P15975 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp53P15975 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp53P15975 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp53P15975 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp53P15975 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp53P15975 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp53P15975 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp53P15975 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp53P15975 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp53P15975 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp53P15975 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp53P15975 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1293.9 ms