Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SptbP15508 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SptbP15508 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SptbP15508 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SptbP15508 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SptbP15508 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SptbP15508 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SptbP15508 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SptbP15508 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SptbP15508 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SptbP15508 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SptbP15508 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SptbP15508 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SptbP15508 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SptbP15508 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SptbP15508 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SptbP15508 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SptbP15508 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SptbP15508 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SptbP15508 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SptbP15508 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SptbP15508 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SptbP15508 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SptbP15508 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SptbP15508 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SptbP15508 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SptbP15508 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SptbP15508 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SptbP15508 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SptbP15508 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SptbP15508 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SptbP15508 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SptbP15508 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SptbP15508 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SptbP15508 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SptbP15508 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SptbP15508 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SptbP15508 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SptbP15508 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SptbP15508 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SptbP15508 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SptbP15508 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SptbP15508 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SptbP15508 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SptbP15508 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SptbP15508 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SptbP15508 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SptbP15508 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SptbP15508 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SptbP15508 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SptbP15508 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SptbP15508 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SptbP15508 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SptbP15508 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SptbP15508 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SptbP15508 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SptbP15508 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SptbP15508 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SptbP15508 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SptbP15508 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SptbP15508 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SptbP15508 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SptbP15508 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SptbP15508 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SptbP15508 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SptbP15508 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SptbP15508 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SptbP15508 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SptbP15508 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SptbP15508 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SptbP15508 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SptbP15508 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SptbP15508 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SptbP15508 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SptbP15508 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SptbP15508 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SptbP15508 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SptbP15508 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SptbP15508 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SptbP15508 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SptbP15508 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SptbP15508 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SptbP15508 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SptbP15508 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SptbP15508 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SptbP15508 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SptbP15508 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SptbP15508 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SptbP15508 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SptbP15508 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SptbP15508 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SptbP15508 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms