Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd44P15379 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd44P15379 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd44P15379 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd44P15379 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd44P15379 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd44P15379 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd44P15379 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd44P15379 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd44P15379 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms