Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DmdP11531 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DmdP11531 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DmdP11531 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DmdP11531 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DmdP11531 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DmdP11531 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DmdP11531 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DmdP11531 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DmdP11531 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DmdP11531 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DmdP11531 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DmdP11531 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DmdP11531 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
DmdP11531 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
DmdP11531 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DmdP11531 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DmdP11531 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DmdP11531 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DmdP11531 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DmdP11531 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DmdP11531 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DmdP11531 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DmdP11531 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DmdP11531 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DmdP11531 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DmdP11531 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DmdP11531 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DmdP11531 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DmdP11531 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DmdP11531 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DmdP11531 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DmdP11531 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DmdP11531 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DmdP11531 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DmdP11531 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DmdP11531 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DmdP11531 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DmdP11531 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DmdP11531 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DmdP11531 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DmdP11531 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DmdP11531 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DmdP11531 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DmdP11531 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DmdP11531 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DmdP11531 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DmdP11531 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DmdP11531 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DmdP11531 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DmdP11531 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DmdP11531 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DmdP11531 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DmdP11531 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DmdP11531 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DmdP11531 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DmdP11531 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DmdP11531 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DmdP11531 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DmdP11531 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DmdP11531 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DmdP11531 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DmdP11531 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DmdP11531 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DmdP11531 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DmdP11531 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DmdP11531 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DmdP11531 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DmdP11531 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DmdP11531 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DmdP11531 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DmdP11531 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DmdP11531 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DmdP11531 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DmdP11531 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DmdP11531 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DmdP11531 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DmdP11531 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DmdP11531 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DmdP11531 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DmdP11531 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DmdP11531 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DmdP11531 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DmdP11531 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DmdP11531 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DmdP11531 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DmdP11531 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DmdP11531 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DmdP11531 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DmdP11531 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DmdP11531 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DmdP11531 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DmdP11531 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DmdP11531 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DmdP11531 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DmdP11531 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DmdP11531 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DmdP11531 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DmdP11531 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DmdP11531 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms