Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lire1P11260 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lire1P11260 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lire1P11260 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lire1P11260 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lire1P11260 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lire1P11260 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lire1P11260 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lire1P11260 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lire1P11260 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lire1P11260 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lire1P11260 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lire1P11260 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lire1P11260 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lire1P11260 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lire1P11260 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lire1P11260 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lire1P11260 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lire1P11260 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lire1P11260 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lire1P11260 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lire1P11260 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lire1P11260 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lire1P11260 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lire1P11260 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lire1P11260 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lire1P11260 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lire1P11260 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lire1P11260 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lire1P11260 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lire1P11260 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lire1P11260 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lire1P11260 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lire1P11260 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lire1P11260 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms