Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp1P11103 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp1P11103 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp1P11103 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp1P11103 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp1P11103 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Parp1P11103 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp1P11103 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp1P11103 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp1P11103 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Parp1P11103 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Parp1P11103 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp1P11103 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp1P11103 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp1P11103 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp1P11103 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp1P11103 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp1P11103 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms