Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcl2P10889 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcl2P10889 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl2P10889 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcl2P10889 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms