Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CatspereP0DP43 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CatspereP0DP43 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CatspereP0DP43 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CatspereP0DP43 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CatspereP0DP43 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CatspereP0DP43 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CatspereP0DP43 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms