Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa9P09631 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa9P09631 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa9P09631 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa9P09631 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa9P09631 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms