Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa1P09022 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa1P09022 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa1P09022 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa1P09022 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms