Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApoeP08226 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApoeP08226 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApoeP08226 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApoeP08226 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApoeP08226 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApoeP08226 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApoeP08226 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApoeP08226 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ApoeP08226 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApoeP08226 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApoeP08226 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ApoeP08226 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApoeP08226 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApoeP08226 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApoeP08226 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms