Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01837 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01837 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01837 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01837 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01837 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01837 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01837 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01837 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01837 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01837 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01837 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01837 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01837 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01837 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01837 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01837 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01837 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01837 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01837 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01837 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01837 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01837 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01837 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01837 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01837 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01837 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01837 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01837 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01837 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01837 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01837 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01837 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01837 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01837 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01837 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01837 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01837 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01837 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01837 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01837 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01837 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01837 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01837 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01837 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01837 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01837 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01837 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01837 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01837 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01837 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01837 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01837 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01837 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01837 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01837 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01837 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01837 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01837 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01837 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01837 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01837 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01837 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01837 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01837 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01837 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01837 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01837 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01837 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01837 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01837 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01837 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01837 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01837 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01837 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01837 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01837 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01837 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01837 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01837 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01837 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01837 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01837 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms