Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01728 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01728 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01728 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01728 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01728 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01728 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01728 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01728 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01728 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01728 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01728 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01728 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01728 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01728 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01728 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01728 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01728 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01728 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01728 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01728 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01728 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01728 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01728 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01728 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01728 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01728 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01728 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01728 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01728 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01728 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01728 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01728 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01728 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01728 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01728 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01728 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01728 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01728 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01728 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01728 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01728 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01728 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01728 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01728 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01728 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01728 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01728 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01728 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01728 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01728 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01728 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01728 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01728 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01728 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01728 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01728 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01728 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01728 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01728 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01728 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01728 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01728 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01728 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01728 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01728 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01728 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01728 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01728 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01728 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01728 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01728 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01728 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01728 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01728 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01728 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01728 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01728 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01728 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01728 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01728 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01728 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01728 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01728 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01728 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01728 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01728 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01728 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01728 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01728 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01728 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01728 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01728 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01728 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01728 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01728 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01728 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01728 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01728 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01728 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms