Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01636 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01636 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01636 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01636 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01636 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01636 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01636 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01636 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01636 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01636 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P01636 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01636 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01636 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01636 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01636 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01636 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01636 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01636 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01636 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01636 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P01636 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01636 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01636 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01636 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
P01636 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01636 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01636 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01636 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01636 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01636 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01636 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01636 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01636 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
P01636 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01636 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01636 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01636 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01636 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01636 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01636 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01636 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01636 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01636 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01636 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01636 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01636 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01636 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01636 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01636 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01636 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01636 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01636 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01636 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01636 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01636 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01636 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01636 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01636 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01636 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01636 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P01636 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01636 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01636 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01636 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01636 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01636 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01636 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P01636 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01636 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01636 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01636 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P01636 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01636 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01636 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01636 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01636 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01636 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01636 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01636 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01636 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01636 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01636 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01636 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01636 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01636 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01636 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01636 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01636 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01636 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01636 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms