Protein–RNA interactions for Protein: P01592

Jchain, Immunoglobulin J chain, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JchainP01592 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JchainP01592 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
JchainP01592 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
JchainP01592 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
JchainP01592 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
JchainP01592 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
JchainP01592 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
JchainP01592 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JchainP01592 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JchainP01592 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JchainP01592 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JchainP01592 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JchainP01592 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
JchainP01592 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
JchainP01592 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JchainP01592 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JchainP01592 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JchainP01592 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
JchainP01592 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
JchainP01592 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
JchainP01592 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
JchainP01592 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
JchainP01592 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
JchainP01592 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JchainP01592 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JchainP01592 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JchainP01592 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
JchainP01592 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
JchainP01592 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JchainP01592 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
JchainP01592 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JchainP01592 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JchainP01592 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
JchainP01592 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JchainP01592 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JchainP01592 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JchainP01592 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JchainP01592 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JchainP01592 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
JchainP01592 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
JchainP01592 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JchainP01592 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JchainP01592 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JchainP01592 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
JchainP01592 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JchainP01592 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JchainP01592 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JchainP01592 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JchainP01592 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JchainP01592 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JchainP01592 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JchainP01592 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
JchainP01592 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JchainP01592 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
JchainP01592 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JchainP01592 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JchainP01592 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
JchainP01592 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
JchainP01592 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JchainP01592 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JchainP01592 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JchainP01592 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JchainP01592 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JchainP01592 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JchainP01592 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JchainP01592 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JchainP01592 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JchainP01592 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JchainP01592 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
JchainP01592 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
JchainP01592 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JchainP01592 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JchainP01592 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
JchainP01592 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
JchainP01592 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JchainP01592 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JchainP01592 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
JchainP01592 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JchainP01592 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JchainP01592 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JchainP01592 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JchainP01592 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JchainP01592 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JchainP01592 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
JchainP01592 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
JchainP01592 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
JchainP01592 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JchainP01592 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JchainP01592 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JchainP01592 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms