Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vti1aO89116 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vti1aO89116 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vti1aO89116 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vti1aO89116 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vti1aO89116 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms