Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CpdO89001 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CpdO89001 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CpdO89001 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CpdO89001 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CpdO89001 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CpdO89001 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CpdO89001 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CpdO89001 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CpdO89001 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CpdO89001 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CpdO89001 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CpdO89001 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CpdO89001 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CpdO89001 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CpdO89001 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CpdO89001 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CpdO89001 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CpdO89001 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CpdO89001 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CpdO89001 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CpdO89001 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CpdO89001 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CpdO89001 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CpdO89001 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CpdO89001 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CpdO89001 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CpdO89001 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CpdO89001 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CpdO89001 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CpdO89001 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CpdO89001 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CpdO89001 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CpdO89001 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CpdO89001 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CpdO89001 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CpdO89001 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CpdO89001 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CpdO89001 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CpdO89001 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CpdO89001 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CpdO89001 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CpdO89001 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CpdO89001 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CpdO89001 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CpdO89001 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CpdO89001 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CpdO89001 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CpdO89001 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CpdO89001 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CpdO89001 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CpdO89001 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CpdO89001 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CpdO89001 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CpdO89001 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CpdO89001 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CpdO89001 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CpdO89001 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CpdO89001 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CpdO89001 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CpdO89001 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CpdO89001 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CpdO89001 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CpdO89001 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CpdO89001 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CpdO89001 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CpdO89001 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CpdO89001 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CpdO89001 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CpdO89001 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CpdO89001 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CpdO89001 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CpdO89001 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CpdO89001 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CpdO89001 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CpdO89001 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CpdO89001 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CpdO89001 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CpdO89001 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CpdO89001 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CpdO89001 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CpdO89001 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CpdO89001 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CpdO89001 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CpdO89001 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CpdO89001 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CpdO89001 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CpdO89001 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CpdO89001 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CpdO89001 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CpdO89001 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CpdO89001 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CpdO89001 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CpdO89001 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CpdO89001 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CpdO89001 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CpdO89001 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CpdO89001 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CpdO89001 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CpdO89001 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms