Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn2O88703 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hcn2O88703 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn2O88703 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn2O88703 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn2O88703 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1099.8 ms