Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3fO88632 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3fO88632 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3fO88632 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3fO88632 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3fO88632 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema3fO88632 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema3fO88632 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema3fO88632 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema3fO88632 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms