Protein–RNA interactions for Protein: O88329

Myo1a, Unconventional myosin-Ia, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1aO88329 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Myo1aO88329 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myo1aO88329 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo1aO88329 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myo1aO88329 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms