Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly86O88188 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly86O88188 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly86O88188 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly86O88188 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly86O88188 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly86O88188 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly86O88188 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly86O88188 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly86O88188 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ly86O88188 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly86O88188 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly86O88188 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly86O88188 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly86O88188 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms