Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtssO70370 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtssO70370 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtssO70370 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtssO70370 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CtssO70370 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtssO70370 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtssO70370 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CtssO70370 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtssO70370 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtssO70370 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtssO70370 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtssO70370 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtssO70370 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtssO70370 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtssO70370 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtssO70370 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtssO70370 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtssO70370 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtssO70370 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtssO70370 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtssO70370 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtssO70370 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtssO70370 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtssO70370 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtssO70370 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtssO70370 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtssO70370 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtssO70370 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtssO70370 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CtssO70370 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtssO70370 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtssO70370 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtssO70370 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtssO70370 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtssO70370 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtssO70370 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtssO70370 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtssO70370 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtssO70370 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtssO70370 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtssO70370 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtssO70370 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtssO70370 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtssO70370 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtssO70370 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CtssO70370 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtssO70370 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtssO70370 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtssO70370 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtssO70370 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtssO70370 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CtssO70370 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtssO70370 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtssO70370 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtssO70370 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtssO70370 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtssO70370 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CtssO70370 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtssO70370 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtssO70370 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtssO70370 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtssO70370 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtssO70370 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtssO70370 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtssO70370 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtssO70370 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtssO70370 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtssO70370 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtssO70370 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtssO70370 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtssO70370 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtssO70370 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtssO70370 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtssO70370 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtssO70370 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtssO70370 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtssO70370 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtssO70370 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtssO70370 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtssO70370 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtssO70370 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtssO70370 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CtssO70370 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtssO70370 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtssO70370 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtssO70370 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtssO70370 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtssO70370 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtssO70370 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CtssO70370 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtssO70370 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtssO70370 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtssO70370 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtssO70370 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CtssO70370 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtssO70370 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtssO70370 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtssO70370 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtssO70370 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms