Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lnx1O70263 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lnx1O70263 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lnx1O70263 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lnx1O70263 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms