Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx4O55187 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cbx4O55187 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx4O55187 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx4O55187 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx4O55187 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx4O55187 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms