Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dsg2O55111 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg2O55111 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg2O55111 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg2O55111 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms