Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms