Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nck2O55033 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nck2O55033 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nck2O55033 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nck2O55033 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nck2O55033 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nck2O55033 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nck2O55033 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nck2O55033 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nck2O55033 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nck2O55033 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nck2O55033 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nck2O55033 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nck2O55033 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nck2O55033 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms