Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Limk2O54785 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limk2O54785 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limk2O54785 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limk2O54785 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limk2O54785 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk2O54785 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limk2O54785 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limk2O54785 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk2O54785 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms