Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppfibp2O35711 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppfibp2O35711 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppfibp2O35711 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppfibp2O35711 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppfibp2O35711 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppfibp2O35711 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppfibp2O35711 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppfibp2O35711 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppfibp2O35711 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ppfibp2O35711 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppfibp2O35711 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppfibp2O35711 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppfibp2O35711 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms