Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn9O35239 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn9O35239 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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Ptpn9O35239 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn9O35239 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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Ptpn9O35239 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn9O35239 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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