Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltbp2O08999 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ltbp2O08999 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ltbp2O08999 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ltbp2O08999 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ltbp2O08999 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms