Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ephb6O08644 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb6O08644 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb6O08644 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms